Luister

Toewijzingen Open Science Fund 2023

30 projecten op het gebied van Open Science krijgen een financiële impuls van maximaal 50.000 euro. Hieronder volgt een alfabetische lijst met de gehonoreerde onderzoekers, hun projectteamleden, en publiekssamenvattingen van hun onderzoeksprojecten.

Alle gehonoreerde onderzoekers, hun projectteamleden, en publiekssamenvattingen

A

Opening Up Research Findings In Applied Linguistics: Consolidating And Extending OASIS
prof. dr. S.J. Andringa - University of Amsterdam

Teamleden:

  • I. Alferink (University of York, UK),
  • E. Marsden (University of York, UK),
  • C. Bolibaugh (University of York, UK)

OASIS is een open database van toegankelijke samenvattingen van hoogwaardig onderzoek op het gebied van de toegepaste taalwetenschap, die continu gevoed wordt door de belangrijkste tijdschriften in het veld. Door de productie van samenvatting onderdeel te maken van het publicatieproces, maakt OASIS onderzoek fysiek en – belangrijker nog – conceptueel toegankelijk voor onderwijzers, cursus- en toetsontwerpers, beleidsmakers op het gebied van onderwijs en kansengelijkheid, ouders/verzorgers, etc. Ter versterking van OASIS wordt in dit project 1) bewijs verzameld voor de impact van OASIS; 2) het bereik van de database vergroot; 3) het aantal voedende tijdschriften vergroot en 4) structurele financiële ondersteuning gezocht.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. S.J. Andringa op ORCID

Tracking and Mainstreaming Replications across the Social, Behavioral and Cognitive Sciences
dr. F.A. de Azevedo Neto (University of Groningen)

Teamleden:

Replicaties van eerder wetenschappelijk werk zijn essentieel om wetenschappelijke kennis te vergroten. Ondanks hun relevantie worden replicatiestudies te weinig gebruikt en geciteerd, wat leidt tot een vertekend beeld van de literatuur. Om acceptatie van replicatiestudies en breder gebruik in onderzoek, onderwijs en beleid te stimuleren, stellen wij voor om (1) een uitgebreide database te ontwikkelen en onderhouden waarin replicatiebijdragen worden gecatalogiseerd door crowdsourcing; (2) twee interactieve apps te ontwikkelen voor het vinden, verkennen en visualiseren van replicaties die veldspecifieke metawetenschappelijke analyses mogelijk maken; (3) outreach-activiteiten uit te voeren om te verhelderen hoe men het beste gebruik maakt van onze materialen.

Bekijk het onderzoek van dr. F.A. de Azevedo Neto op ORCID

B

Curated Repository for Generative Models in Psychological Science (PsychoModels)
prof. dr. D. Borsboom (University of Amsterdam)

Teamleden:

Dit project heeft tot doel het creëren van een opslagplaats die het delen, hergebruiken en uitbreiden van computationele implementaties van formele modellen in de psychologie stimuleert. Door een platform te creëren dat is ontworpen voor productieve uitwisseling, zowel binnen modelleringsgroepen als tussen modelleurs en onderzoekers, zullen modelleringspraktijken worden gevoed en verder ontwikkeld. Dit platform zal traditionele publicatieformats aanvullen met een gestructureerde database die computationele implementaties meer FAIR maakt, open code sharing-praktijken aanvult en communicatie tussen theoretische en empirische psychologen gemakkelijker maakt.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. D. Borsboom op ORCID

The Ph-Air data project: human physiology data unlocked, recoded and educated.
dr. V.C.J. de Boer (Wageningen University & Research)

Teamleden:

Het openlijk delen van menselijke fysiologische gegevens wordt belemmerd door privacykwesties en het gebruik van gesloten software. Met ons Ph-air-data project willen we de acceptatie van open data-uitwisseling voor fysiologische wetenschap verbeteren door obstakels weg te nemen, hulpmiddelen te bieden en de volgende generatie fysiologen op te leiden. Concreet streven we naar 1) implementeren van synthetische datasets van fysiologische gegevens om diep te kunnen anonimiseren, 2) hercoderen van de fysiologische gegevens analyses van gesloten software naar R, en 3) bouwen van blauwdrukken en educatieve hulpmiddelen om te verspreiden hoe gegevens delen het beste kan worden uitgevoerd bij fysiologisch onderzoek.

Bekijk het onderzoek van dr. V.C.J. de Boer op ORCID

E

VegTrack360, a cost-effective open-source rotating camera system for continuous monitoring of weather impacts on vegetation and agriculture.
dr. F.J. Ellsäßer (University of Twente)

Teamleden:

Extreme weersomstandigheden zoals droogte, overstromingen en hittegolven komen door klimaatverandering steeds vaker voor. Hun impact op gewassen en ecosystemen is immens, maar het ontbreekt aan adequate instrumenten om in-situ gegevens over deze effecten te verzamelen. Wij stellen een eenvoudig, maar doeltreffend instrument voor om dit te bereiken, de VegTrack360. Een camera op een paal wordt elke paar minuten 360° gedraaid om panoramisch beelden te verkrijgen. Met behulp van edge-computing worden deze beelden omgezet in 2D- en 3D-afbeeldingen van het gebied, waardoor de weerseffecten op vegetatie in real time kunnen worden gevolgd, hetgeen uiteindelijk zal helpen om klimaatslimme landbouw te ontwikkelen.

Bekijk het onderzoek van dr. F.J. Ellsässer op ORCID
 

Moisture Tracking for Climate Models: a Community Effort
dr. ir. R.J. van der Ent (Delft University of Technology)

Teamleden:

In dit project werkt een onderzoeksgemeenschap samen om verschillende bestaande tools door te ontwikkelen zodat die in staat zijn om fictieve waterdeeltjes te volgen door de atmosfeer binnen klimaatmodellen. Ze willen tot meer inzicht komen betreffende de voor- en nadelen van de verschillende tools in termen van nauwkeurigheid, rekensnelheid, gebruiksvriendelijkheid en dataopslag. Door het toepassen van Open Science-principes zullen ze makkelijker van elkaars tools gebruik kunnen maken, van elkaar kunnen leren en verbeteringen kunnen doorvoeren. Ook zullen nieuwe gebruikers een betere afweging kunnen maken van welke tool het meest geschikt is voor hun specifieke onderzoeksvraag.

Bekijk het onderzoek van dr. ir. R.J. van der Ent op ORCID

G

Handwritten Archival Data Structuring with Regex Recognition (HANDS-RX)
dr. C.W. van Galen (Radboud University)

Teamleden:

Hoe maak je van scans van archiefstukken op grote schaal gestructureerde onderzoekdata? Dat is de centrale vraag van HANDS-RX.  Archieven worden op grote schaal gedigitaliseerd, maar het op dezelfde grote schaal omzetten van deze scans in data is lastig. Deze aanvraag richt zich op data-extractie via regular expression (regex), waarbij met software elementen uit archiefstukken geselecteerd en gestructureerd worden. In dit project richten we ons in eerste plaats op het automatisch genereren van datasets uit koloniale Burgerlijke Stand akten, maar het doel is om deze technieken zo breed mogelijk toepasbaar te maken voor scans van, met name, handgeschreven archieven.

Bekijk het onderzoek van dr. C.W. van Galen op ORCID

Validation of artificial intelligence software in radiology: Project AIR
prof. dr. B. van Ginneken (Radboud UMC)

Teamleden:

Meer dan 200 commerciële AI-producten zijn beschikbaar voor radiologie, maar testen en vergelijken is lastig. Eerder ontwikkelden we een open-source framework (Project AIR) om prestaties van vergelijkbare AI-producten te vergelijken op een geheime benchmark dataset. AI-software is alleen niet statisch (algoritmes worden bijgewerkt en nieuwe producten worden gelanceerd) en werkt niet per definitie op alle populaties (generaliseerbaarheid van AI). Daarom willen we met Project AIRborne continue evaluatie mogelijk maken van commerciële AI producten op externe data. Dit geeft up-to-date inzicht in prestaties op verschillende populaties. Resultaten worden gepubliceerd op een Grand-Challenge.org leaderboard en AIforRadiology.com.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. B. van Ginneken op ORCID

AwakeRodent: the awake rodent whole-brain imaging multi-center study
dr. J. Grandjean (Radboud UMC)

Teamleden:

  • M.M. Chakravarty (McGill University, Montreal, Canada),
  • M. Aswendt (University of Cologne, Germany),
  • O. Esteban (Lausanne University Hospital and University of Lausanne, Switzerland)

Dieronderzoek heeft dringend behoefte aan een open wetenschappelijke revolutie! Traditionele barrières voor het delen van data gelden niet voor data die bij dieren zijn verzameld. Toch is de open wetenschapsmentaliteit nog niet doorgedrongen tot de dierenonderzoeksgemeenschap. Wij brengen daar actief verandering in. Om het zullen we datasets van meerdere beeldvormingscentra voor dieren wereldwijd verzamelen, en open software verspreiden. Om laboratoria in staat te stellen open wetenschappelijke praktijken toe te passen, zullen we workshops organiseren om technische kennis over te dragen. Door het goede voorbeeld te geven hopen we de volgende generatie dieronderzoekers te inspireren.

Bekijk het onderzoek van dr. J. Grandjean op ORCID

H

Bottom-up Open Science Education for graduate students in the medical and life sciences across the Netherlands [BOSE]
prof. dr. N.E.M. van Haren (Erasmus MC)

Teamleden:

Het belang van open science wordt in toenemende mate erkend, maar adoptie van deze werkwijzen is nog steeds beperkt in het medische veld. Om een bredere adoptie te stimuleren is het essentieel om de volgende generatie onderzoekers kennis te laten maken met de filosofie achter open science en praktische open science-werkwijzen. Binnen dit project zullen we een hands-on cursus ontwikkelen en verspreiden, gericht op PhD-studenten die binnen de universitair medische centra in Nederland werken. Hiermee ontwikkelen jonge onderzoekers de vaardigheden om open science in hun eigen werk toe te passen, wat zal leiden tot een bredere implementatie van open science.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. N.E.M. van Haren op ORCID


HCCL: Hedy: Community, Content and Localisation
dr. ir. F.F.J. Hermans (VU Amsterdam)

Teamleden:

/

Het Hedy-programmeerplatform heeft een actieve gebruikersgroep van leraren over de hele wereld, die Hedy niet alleen gebruiken om les te geven, maar ook lesplannen en vertalingen bijdragen. We hebben momenteel ongeveer 400.000 actieve gebruikers per maand en ongeveer 200 bijdragers. Binnen deze nieuwe, open manier om onderwijskundig onderzoek naar docenten te brengen, zonder de traditionele tussenstap van een educatieve uitgeverij, werken onderzoekers en docenten op gelijke voet samen. Onze community is de afgelopen jaren enorm gegroeid, dus er is meer ondersteuning nodig om de community te versterken, om goede lesplannen te vinden en om lokalisatie te verbeteren.

Bekijk het onderzoek van dr. ir. F.F.J. Hermans op ORCID

The effect of a study’s open data policy on participants’ engagement, diversity of the sample, and data quality.
dr. T. Heyman (Leiden University)

Teamleden:

Bij studies waarbij data van menselijke deelnemers worden verzameld, dienen onderzoekers toelating te vragen vooraleer ze deze data publiekelijk beschikbaar kunnen maken. Echter wordt er in desbetreffende toestemmingsformulieren niet altijd vermeld hoe de data van deelnemers zullen worden behandeld, wat data-herbruikbaarheid beperkt, of wordt het op een dermate onduidelijke wijze gecommuniceerd dat mensen zich niet realiseren waarmee ze instemmen. Het huidige project zal verschillende toestemmingsmethodes beschouwen die deze problemen aanpakken, waarbij we zullen onderzoeken of ze een invloed hebben op het engagement van deelnemers, de diversiteit van de steekproef, en de datakwaliteit.

Bekijk het onderzoek van dr. T. Heyman op ORCID

Unlocking the impact potential of research software in acoustics
prof. dr. ir. M.C.J. Hornikx (Eindhoven University of Technology)

Teamleden:

Dit project heeft tot doel een cultuurverandering te bevorderen met betrekking tot good practices in open science bij de ontwikkeling en verspreiding van onderzoekssoftware in het vakgebied van de akoestiek. Bovendien wil het de manier waarop onderzoekers onderzoekssoftware publiceren versnellen. Deze doelen worden bereikt via goed voorbereide workshops volgens best practices standaarden betreffende open science, die tijdens een conferentie en een PhD-school aan de internationale onderzoeksgemeenschap op een terugkerende manier worden aangeboden. Het verwachtte resultaat is een verhoogde impact en reproduceerbaarheid van onderzoek in de akoestiek, en de start van een open science community in dit vakgebied.

Bekijk het onderzoek van Prof. dr. ir. M.C.J. Hornikx op ORCID

IVE-R: An Open Source Tool for Creating Immersive Virtual Environments using R
dr. W.S.K. Hurst (Wageningen University & Research)

Teamleden:

Dit project behelst het ontwikkelen van een open source tool voor het creëren van immersieve virtuele omgevingen (IVE-R). IVE-R pakt de bestaande beperkingen voor geospatiale immersieve visualisaties aan door open 3D-datavisualisatietools en VR-ontwikkelingssoftware te combineren om gebruikers in staat te stellen immersieve inhoud te integreren in hun onderzoeksoutput (bijvoorbeeld voor steden, bossen, of gebouwen). IVE-R combineert de robuuste geospatiale tools van R en A-frame voor het creëren van 3D en immersieve visualisaties.

Bekijk het onderzoek van dr. W.S.K. Hurst op ORCID

K

Love Open Science: bridging the gap between citizens and science through a social media platform researching love
prof. dr. M.E. Kret (Leiden University)

Teamleden:

Het project "Love Open Science" stimuleert open wetenschap door het toegankelijk te maken voor juist mensen die nauwelijks ermee in aanraking komen. Door wetenschap meer begrijpelijk te maken wordt het relevanter voor een breed publiek. Om deze reden creëren we met dit project een social-mediakanaal over liefde en relaties. Het doel: gewone burgers kunnen deel kunnen nemen aan het hele wetenschappelijke proces, met reacties, vragen, ideeën en zelfs participatie. Door gebruik te maken van social-media als hulpmiddel voor open-wetenschappelijke gegevensverzameling, worden nieuwe manieren gevonden om wetenschappelijke resultaten te verzamelen en publiceren, op een toegankelijke en activerende manier.

Bekijk het onderzoek van Prof. dr. M.E. Kret op ORCID

L

Making sensitive data reusable through synthetic data generation – SENSYN
prof. dr. M. Liem (Leiden University)

Teamleden:

Het doel van project SENSYN is om het delen van data en de implementatie van FAIR principes te stimuleren in onderzoeksgebieden die met gevoelige persoonsdata werken en door privacyregelingen hierin beperkt worden. Met toegankelijke handleidingen willen wij het gebruik van differentiële private synthetische datasets als een oplossingen voor deze beperkingen introduceren en stimuleren. Daarnaast willen wij door het ontwikkelen van een gebruikersvriendelijke, interactieve en publiek toegankelijke website met een synthetisch dataset over moord en doodslag in Nederland het nut van dit type data voor het gebruik van niet-academische gebruikers demonstreren.

Bekijk het onderzoek van Prof. dr. M. Liem op ORCID

M

BiG-CoDeC: Biosynthetic Genomics Community-Driven Curation
prof. dr. M.H. Medema (Wageningen University & Research)

Teamleden:

Natuurlijke metabolieten zijn een rijke bron van medicijnen en gewasbeschermingsmiddelen. Wij hebben opensource softwaretools gebouwd voor grootschalige genoomexploratie van nieuwe metabolieten, verbonden met een online community-gedreven repository die de standaard is geworden voor gecureerde experimenteel gekarakteriseerde biosynthetische genclusters (BGCs) die coderen voor de productie van deze moleculen. Deze database, MIBiG, is tot stand gekomen door middel van open science-initiatieven, die succesvol waren maar professionalisering behoeven. Daartoe willen we het indienen en annoteren van BGC-gegevens door de gemeenschap bevorderen door middel van verbeterde online systemen, en hergebruik van gegevens stimuleren door geautomatiseerde queries en interoperabiliteit met andere bronnen.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. M.H. Medema op ORCID

O

Vendor agnostic MR pulse programming - VAMPP
prof. dr. ir. M.J.P. van Osch (Leiden UMC)

Teamleden:

MRI wordt zowel voor klinische als wetenschappelijke doeleinden gebruikt. Dit is mogelijk door de vele verschillende scansequenties die allemaal andere beeld-contrasten en dus informatie opleveren (bv anatomische versus fysiologische beelden, maar ook functionele MRI). De ontwikkelomgeving voor deze sequenties is echter afgeschermd door de fabrikanten en alleen toegankelijk onder geheimhoudingsverklaringen. Onderwijs over MR fysica, implementatie van nieuwe sequenties en transparantie over en reproductie van onderzoekresultaten zijn hierdoor onnodig lastig. In dit project werken we verder aan een Philips-driver voor een open pulsprogrammeeromgeving en demonstreren deze aan de hand van een geavanceerde sequentie, MR Fingerprinting, op Philips, GE en Siemens scanners.

Bekijk het onderzoek van dr. ir. M.J.P. van Osch op ORCID

P

OPER3D: Open Publishing and Peer Review for 3D Scholarship
dr. K. Papadopoulos (Maastricht University)

Teamleden:

  • S. Schreibman (Maastricht University),
  • D. Roorda (KNAW Humanities Cluster, Digital Infrastructure),
  • T. Tasovac (DARIAH: The Pan-European Digital Research Infrastructure for the Arts and Humanities),
  • S. Mallick (Maastricht University)

Opdat 3D-content zijn plaats zou kunnen innemen als wetenschappelijke output, moet het onderworpen worden aan de typische processen van publicatie en peer review. Het doel van OPER3D is om concrete en gedeelde workflows en best practices te ontwikkelen voor het publiceren en peer-reviewen van 3D-gebaseerd onderzoek, en uiteindelijk de manier te veranderen waarop 3D-wetenschap wordt geëvalueerd, gepubliceerd en erkend. Dit project sluit aan bij recente initiatieven om de beoordeling van onderzoek te hervormen en te onderzoeken hoe wetenschappelijke resultaten die en afwijken van de gevestigde wetenschappelijke praktijken en conventionele publicatievormen kunnen worden erkend en geëvalueerd.

Bekijk het onderzoek van dr. K. Papadopoulos op ORCID

R

Publishing Research Output Continuously (PROCess): The case of modular publishing
dr. D. van Ravenzwaaij (University of Groningen)

Teamleden:

Veel nieuwe hulpmiddelen worden gecreëerd ten behoeve van Open Science, echter is deelname van de onderzoekersgemeenschap nodig om korte-termijn veranderingen in duurzame culturele en gedragsveranderingen om te zetten. In dit project werken wij samen met modulair publicatieplatform ResearchEquals om een praktijkgemeenschap te ontwikkelen omtrent modulaire verspreiding van onderzoek. We verzamelen feedback van de praktijkgemeenschap om trainingssessies te ontwikkelen, waarmee onderzoekers op weg geholpen worden met het publiceren van elke stap van hun projectpijplijn en om ontwikkelingen van het ResearchEquals-platform te stroomlijnen. Om het trainingsmateriaal ook na de looptijd van de subsidie te ondersteunen, maken wij een ‘open educational handbook.’

Bekijk het onderzoek van dr. D. van Ravenzwaaij op ORCID

S

Open Hardware Electron Paramagnetic Resonance (OHEPR)
dr. V. Saggiomo (Wageningen University & Research)

Teamleden:

  • N. Sharma (Wageningen University & Research),
  • J. Krug (Wageningen University & Research)

Open Hardware speelt een cruciale rol in het bevorderen van Open Science, en we streven ernaar om het eerste OH instrument EPR ter wereld te ontwikkelen. Ondanks het belang ervan in verschillende laboratoria wordt het EPRinstrument nog steeds behandeld als een black box. Door een Open Hardware-versie te creëren, hopen we meer wetenschappers aan te moedigen om betrokken te raken bij Open Science-projecten en transparantie in wetenschappelijk onderzoek te bevorderen. Ons uiteindelijke doel is om de weg vrij te maken voor meer Open Hardware-projecten in wetenschap en daarbuiten.

Bekijk het onderzoek van dr. V. Saggiomo op ORCID


OpenSimViz: Open infrastructure for efficient remote simulation big data dissemination and visualisation
dr. M. Schaller (Leiden University)

Teamleden:

Kosmologische simulaties modelleren een representatief deel van het heelal. Wij zullen een nieuwe webinterface ontwikkelen en beschikbaar stellen waarmee gebruikers simulatie datasets ter grootte van een petabyte kunnen doorzoeken, opdelen, opvragen en visualiseren. Door gebruikers automatisch slechts het deel van de data te sturen dat ze nodig hebben voor hun specifieke analyse, stellen we iedereen met een internetverbinding in staat om de simulatieresultaten te gebruiken. Dit in tegenstelling tot de huidige situatie waarin onderzoekers zelf de gehele dataset moeten opslaan en bewerken. De verwachting is dat dankzij dit project veel meer onderzoekers gebruik zullen kunnen maken van grootschalige simulaties.

Bekijk het onderzoek van dr. M. Schaller op ORCID


C-START Generate interoperable Cohort datasets and STimulate their use And Reuse to study multimorbidity in The Netherlands
dr. M.T. Schram (Maastricht University)

Teamleden:

Cohortstudies zijn kampioen in het verzamelen van lange termijn gezondheidsgegevens, sommigen verzamelen al meer dan 50 jaar gezondheidsdata. In dit project genereren we een herbruikbare richtlijn om interoperabele datasets te creëren afkomstig van 11 cohortstudies. Hiermee worden de eerste stappen gezet voor het structureel, lange termijn delen van privacy gevoelige gezondheidsdata van ~500.000 deelnemers van deze cohort studies. De richtlijn beschrijft alle processtappen die nodig zijn om de datasets te inventariseren, te harmoniseren en te combineren, en zal toepasbaar zijn op een veelheid van toekomstige onderzoeksvragen. Als proof of principle wordt de richtlijn getest in een pilotstudie.

Bekijk het onderzoek van dr. M.T. Schram op ORCID

Tangram: open platform for modular, real-time, and data-driven aviation research
dr. J. Sun (Delft University of Technology)

Teamleden:

Tangram is een open onderzoeksraamwerk voor vlucht-surveillancegegevens dat ontstaan is als hobbyproject voor het detecteren van turbulentie. Het heeft potentieel voor diverse real-time luchtvaartonderwerpen, zoals GNSS-jammingdetectie, monitoring van luchtvaartweer, emissieanalyse en prestatiebewaking van luchthavens. De voorlopige versie is momenteel beschikbaar als webapplicatie ontwikkeld in Python en Javascript. Ons uiteindelijke doel is om een volledig functioneel platform te creëren dat real-time open data-analyse mogelijk maakt op een cloudservice of persoonlijke computer. Tangram zal ruwe data verzamelen, waardoor onderzoekers hun eigen codes kunnen integreren voor het uitvoeren van open onderzoeksanalyses.

Bekijk het onderzoek van dr. J. Sun  op ORCID

T

Automatising the publication of CEUR-WS.org workshop proceedings
dr. I. Tiddi (VU Amsterdam)

Teamleden:

Met dit project willen we de open access publicatie workflow van CEUR-WS.org workshop proceedings automatiseren. Het huidige proces vergt veel manuele stappen van zowel de auteurs, de organisatoren van de workshops als ook de editorial board die de uiteindelijke ingediende volumes beoordeelt. We stellen voor dit te verbeteren met een interface die toelaat met weinig moeite volumes samen te stellen. Hiermee kan de data van de open-access publicaties, zoals auteurs-, dataset en software informatie verzameld worden in een gestructureerd en machinaal leesbaar formaat. Dit vergemakkelijkt het permanent publiceren van de volumes en reduceert de werkdruk op de editorial board.

Bekijk het onderzoek van dr. I. Tiddi op ORCID

Evidence based clinical decision making using and open AI-tool  (ABC-AI)
dr. J.K. Tijdink (Amsterdam UMC)

Teamleden:

De opkomst van evidence-based medicine heeft geresulteerd in een enorme hoeveelheid onderzoeksresultaten. Het is lastig voor dokters om up-to-date te blijven en de laatste inzichten te gebruiken in klinische beslissingen. In dit project proberen we met een publiek toegankelijk Artificial Intelligence(AI)-tool dokters op een betrouwbare en tijdbesparende manier te ondersteunen de juiste behandelbeslissingen te maken. In het project testen en verbeteren we de tool met 100 klinisch werkzame artsen. Met de resultaten onderzoeken we in hoeverre open-AI (gebaseerd op wetenschappelijk onderzoek) bijdraagt aan betere behandelingen, door evidentie snel en overzichtelijk te delen en zo de kwaliteit van patiëntenzorg te verbeteren.

Bekijk het onderzoek van dr. J.K. Tijdink ORCID

V

Fostering a national Community-led network to accelerate Open Science practices: Foster OSC-NL
dr. A.E. van 't Veer (Leiden University)

Teamleden:

Open Science Communities (OSCs) zijn lokale, bottom-up initiatieven die als doel hebben om de implementatie van Open Science te versnellen via peer-to-peer leren. Het nationale netwerk van Nederlandse OSC's (OSC-NL; www.osc-nl.com) ondersteunt de twaalf lokale communities en vertegenwoordigt hun bottom-up Open Science perspectieven bij nationale belanghebbenden (bijvoorbeeld op gebied van beleid). Dit project versnelt de impact van dit door de community geleide netwerk door 1) het community management van het netwerk te professionaliseren en 2) mogelijkheden, tijd en middelen te genereren om samen met de onderzoeksgemeenschap de normen te veranderen voor een meer open toekomst.

Bekijk het onderzoek van dr. A.E. van 't Veer ORCID

ShareTrait: an open data resource to achieve a synthesis of the evolution and ecology of traits
dr. W.C.E.P. Verberk (Radboud University)

Teamleden:

  • J. Ellers (Vrije Universiteit Amsterdam),
  • M.P. Berg (Vrije Universiteit Amsterdam),
  • M.  Punt (Netherlands eScience Center)

Eigenschappen van soorten die inzicht geven in de relatie met hun leefomgeving zijn energiehuishouding, ontwikkelingssnelheid en aantal nakomelingen. Echter, data over deze eigenschappen is versnipperd. In het NWO ShareTrait-project hebben we een platform ontwikkeld voor het verzamelen, standaardiseren en omrekenen van degelijke data. We willen nu dit platform opschalen en transformeren tot een waardevolle resource voor andere onderzoekers. Via een top-down aanpak, in samenwerking met biologische tijdschriften, willen we het archiveren van deze data onderdeel te maken van het publicatieproces. Via een bottom-up aanpak willen we onderzoekers stimuleren en faciliteren om hun data beschikbaar te stellen.

Bekijk het onderzoek van dr. W.C.E.P. Verberk op ORCID

CoreBirds: Connecting Open Research outputs in the Ecology of Birds
prof.dr. M.E. Visser (Netherlands Institute of Ecology)

Teamleden:

Open Science heeft als kerndoelen het verhogen van transparantie en reproduceerbaarheid van onderzoek. We gaan hieraan met CoreBirds bijdragen door datasets, analytische codes en publicaties te integreren, waarbij we langetermijnstudies van vogelpopulaties als onderzoeksveld gebruiken. Daarbij bouwen we voort op een al bestaande database en netwerk van onderzoekers (SPI-Birds). Door het opzetten van een bibliotheek van gepeerreviewde codes geven we een belangrijke impuls aan de herbruikbaarheid van code en de transparantie van wetenschap, en verbreden we de SPI-Birds’ gebruikersgroep. We stimuleren hiermee ook andere onderzoeksgemeenschappen in de ‘long tail’ van levenswetenschappen om hun onderzoekscyclus te sluiten.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. M.E. Visser op ORCID

W

Revealing hidden uncertainty with robustness reports (ROBUST)
prof. dr. E.M. Wagenmakers (University of Amsterdam)

Teamleden:

De huidige rapportage-praktijk omvat meestal één primaire statistische analyse, uitgevoerd door één analyseteam. Dit betekent dat het vaak onduidelijk blijft in hoeverre andere plausibele analytische keuzes tot dezelfde conclusie zouden leiden. Bijgevolg blijft veel onzekerheid verborgen onder de oppervlakte, met een misplaatst gevoel van vertrouwen in de robuustheid van de resultaten als mogelijk gevolg. Om deze verborgen onzekerheid aan het licht te brengen, willen wij een rapportage-formaat ontwikkelen en testen waarin onafhankelijke alternatieve analyses centraal staan: Robuustheidsrapporten. Wij willen richtlijnen ontwikkelen voor dit nieuwe formaat en laten zien dat deze praktisch bruikbaar is en toegevoegde waarde heeft als standaard rapportage-optie.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. E.M. Wagenmakers op ORCID

Alle gehonoreerde onderzoekers, hun projectteamleden, en publiekssamenvattingen

B

Improved open-source sustainability of Pastas software through documentation, visualization, and AI-generated tests
Prof. dr. ir. M. Bakker - Delft University of Technology

Teamleden:

De open-source software Pastas wordt gebruikt om tijdreeksen van grondwaterstanden te analyseren, bijvoorbeeld om de oorzaak van lage grondwaterstanden vast te stellen (is het ontrekkingen, gebrek aan neerslag of lage rivierstanden?). Wij stellen voor om het onderhoud en de toepassing van Pastas te verbeteren door de documentatie uit te breiden, voorbeelden van grondwateranalyses over de hele wereld te ontwikkelen, rigoureuze unit tests te implementeren met behulp van kunstmatige intelligentie en een nieuwe open-source visualisatietool te ontwikkelen. Deze ontwikkelingen zullen de toepassing van open science in de tijdreeksanalyse van grondwaterstanden wereldwijd stimuleren, terwijl het project beheersbaar blijft voor de ontwikkelaars.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. ir. M. Bakker op ORCID


OPENOPTICS - Open Science for Optical Simulations
Dr. J.W.M. Beenakker - Leiden UMC

Teamleden:

Ray-tracing is een veelgebruikte techniek om optische systemen, zoals een telescoop of het oog, te bestuderen. Wij hebben ZOSPy ontwikkeld om dit soort analyses te automatiseren. Sinds wij ZOSPy open-source beschikbaar stelden, gebruiken onderzoekers van verschillende disciplines het om hun methodes te delen en te publiceren. In dit project willen we ZOSPy uitbreiden zodat het makkelijker gebruikt kan worden om methodes en resultaten met elkaar te delen. Hierdoor kan ZOSPy een tool worden die Open Science mogelijk maakt voor optische simulaties.

Bekijk het onderzoek van dr. J.W.M. Beenakker op ORCID

FREE SODA – a FAIR Record Collection to unravel Southern Ocean Dynamics in the Past
Dr. P.K. Bijl - Utrecht University,

Teamleden:

De Zuidelijke oceaan is de motor van wereldwijde oceaancirculatie en speelt een cruciale rol in de koolstofkringloop. Reconstructies van de klimaat- en oceaangeschiedenis van de Zuidelijke Oceaan geven fundamentele inzichten in hoe toekomstig klimaat gaat veranderen. Maar hoe is paleo-data goed te vergelijken? In dit project geven we sturing aan dat process via de ontwikkeling van een gestrucureerd FAIR data protocol, lanceren we een platform waarop deze gestructureerde in te laden is, met een visualisatietool van de data voor onderzoek en onderwijs. Dit integreert de kennis en leidt tot nieuwe inzichten in de rol van de zuidelijke oceaan in klimaatverandering.

Bekijk het onderzoek van dr. P.K. Bijl op ORCID

A Platform for Psychology Data Merging and Sharing (GIGAPsych)
Dr. J. Buczny - VU Amsterdam

Teamleden:

Dit project betreft de ontwikkeling van een openbaar toegankelijk platform waar onderzoekers psychologische onderzoekdata kunnen delen en opvragen. Het platform zal data bevatten van panels die een unieke ID aanbieden (bijv. Prolific.co), op basis waarvan data automatisch samengevoegd kunnen worden. De belangrijkste doelen van het project zijn om (a) standaarden te ontwikkelen zodat onderzoekers hun data kunnen delen, (b) gegevenssamenvoeging te automatiseren door middel van machinaal leesbare codeboeken, (c) juridische documenten beschikbaar te stellen om het project wat betreft privacy en gegevensbeheer General Data Protection Regulation (GDPR)-compliant te maken, en (d) downloads en analyses via het platform aan te bieden.

Bekijk het onderzoek van dr. J. Buczny op ORCID

D

Enhancing FAIR data in BioImaging through improving RSpace -iRODS integration
Dr. ir. S.E. Le Devedec - Leiden University

Teamleden:

  • L. Lenoci (Leiden University),
  • V. Plankyte (Research Space)
  • N. Hanlon (Research Space)

Het project zal de integratie verbeteren tussen RSpace, een digitaal onderzoeksplatform, en iRODS, een open-source platform voor gegevensbeheer. RSpace stelt onderzoekers in staat om hun werk te documenteren en te koppelen aan externe gegevensbronnen, terwijl iRODS zorgt voor uniforme naamgeving, opslag en vindbaarheid van onderzoeksdata. De huidige integratie zorgt voor naadloze gegevenskoppelingen, zelfs wanneer externe bronnen veranderen. We zullen de integratie verbeteren door de export van gegevens en metadata mogelijk te maken. Deze verbetering stelt de gegevens van RSpace in staat om naadloos aan te sluiten bij de informatie die wordt beheerd door iRODS, wat essentieel is voor de onderzoeksgemeenschap.

Bekijk het onderzoek van dr. ir.  S.E. Le Devedec op ORCID

G

OpenSTAC: an open spatiotemporal catalog to make geospatial research data findable and accessible
Dr. ing. S. Girgin - University of Twente

Teamleden:

Een grote hoeveelheid onderzoeksgegevens bevatten spatiotemporele elementen, die ze koppelen aan specifieke geografische regio's en tijdsperioden. Hoewel dergelijke informatie zeer nuttig kan zijn bij het vinden en openen van onderzoeksdatasets voor specifieke interessegebieden, blijft deze momenteel grotendeels verborgen en zijn onderzoekers beperkt tot de tekstuele metadata en fundamentele zoekfunctionaliteiten die door de repositories worden geboden om georuimtelijke gegevens te vinden. OpenSTAC heeft tot doel spatiotemporele informatie uit gepubliceerde onderzoeksdatasets te extraheren en toegankelijk te maken via een online catalogus die toegankelijk is voor een groot ecosysteem van tools en applicaties om geospatiale onderzoeksgegevens vindbaar en toegankelijk te maken.

Bekijk het onderzoek van dr. ing. S. Girgin op ORCID

CItizen VoIces in cLImate ActioN (CIVILIAN)
Dr. J.E. Gonçalves - Delft University of Technology)

Teamleden:

  • G. Slingerland (Delft University of Technology)
  • C. Champlin (Delft University of Technology)
  • M.G. Alvarez (Delft University of Technology),
  • T. Verma (Delft University of Technology)

Burgerbetrokkenheid is cruciaal voor het behalen van klimaatdoelstellingen in steden. Digitale platforms kunnen in dit proces een rol spelen, maar zijn over het algemeen niet burgervriendelijk: ze zijn niet aantrekkelijk voor burgers en vereisen technische expertise om iets met de informatie uit het platform te kunnen doen. Dit project ontwikkelt een interactieve interface voor een platform voor burgerbetrokkenheid bij klimaatactie. Middels een actie-onderzoeksaanpak plaatst dit project burgers in het middelpunt van het proces, zodat de resulterende interface voldoet aan hun behoeften. De interface wordt geïntegreerd in Citizen Voice, een open platform in ontwikkeling aan de TU Delft.

Bekijk het onderzoek van dr. J.E. Gonçalves op ORCID

H

JUST-OS for all: An AI-based chatbot for navigating Open Science resources
Dr. R. Hoekstra - University of Groningen

Teamleden:

Ondanks (of dankzij) de overweldigende hoeveelheid informatie over Open Science is het nog altijd niet heel gangbaar. Om deze kloof te overbruggen presenteren wij JUST-OS: een interactieve en toegankelijke chatbot om onderzoekers op weg te helpen binnen Open Science-bronnen. JUST-OS maakt gebruik van retrieval-augmented generation, een AI-gebaseerde natural language processing-methode, die gehost zal worden op de Open Science database op FORRT. JUST-OS informeert en draagt thema’s aan. Hierdoor zal JUST-OS bijdragen de drempel voor Open Science te verlagen, om zo het gedrag van onderzoekers in lijn te brengen met hun overwegend positieve houding ten opzichte van Open Science.

Bekijk het onderzoek van dr. R. Hoekstra op ORCID

Professionalisation and wider adoption of the FAIR Data Cube, a FAIR data infrastructure for integrated multi-omics data analysis
Prof. dr. P.A.C. 't Hoen - Radboud UMC

Teamleden:

Wij stimuleren Open Science in het –omics veld (grootschalige analyses van DNA, eiwitten en metabolieten) door ontwikkeling van de FAIR Data Cube (FDCube). De FDCube omvat software en diensten die onderzoekers in verschillende stadia van de Research Data Life Cycle helpt met het (i) creëren van computer leesbare metadata; (ii) vindbaar en toegankelijk maken van -omics data; (iii) faciliteren van analyse en integratie van -omics data uit verschillende bronnen. Ons voorstel heeft tot doel de adoptie van de FDCube te vergroten door het harmoniseren van metadata schema's, het opleveren van een productieversie en het ontwikkelen van promotie- en trainingsmateriaal.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. P.A.C. 't Hoen op ORCID

fNIRS4all: Functional near infrared spectroscopy for everyone
Dr. R. Hortensius - Utrecht University

Teamleden:

Het menselijk brein kan het best begrepen worden als wetenschappers het in natuurlijke situaties buiten het laboratorium kunnen bestuderen. Dit kan worden bereikt met functionele nabij-infrarood spectroscopie (fNIRS), een nieuwe mobiele beeldvormende-techniek die het mogelijk maakt hersenactiviteit te bestuderen wanneer mensen vrij bewegen en onbeperkte interacties met anderen hebben. In dit project gaan we een open bron (www.openfnirs.nl) ontwikkelen voor het gebruik van fNIRS in onderzoek en onderwijs aan universiteiten. Deze bron bevat uitleg en praktische hulpmiddelen om de gebruiker bij elke stap van fNIRS te begeleiden. Met deze bron kan iedereen fNIRS gebruiken!

Bekijk het onderzoek van dr. R. Hortensius op ORCID

Citizen Science for Spotting Toxic Clouds with AI
Dr. Y. Hsu - University of Amsterdam

Teamleden:

  • K. Rogers (University of Amsterdam)

Bewoners van de IJmond hebben camera's opgesteld om de vervuiling van Tata Steel in de gaten te houden. Op dit moment controleren bewoners handmatig de cameragegevens om giftige wolken te herkennen. Dit voorstel is erop gericht om bewoners te betrekken bij het co-creëren van een AI-tool om vervuiling te identificeren. We zullen gebruik maken van etnografische observaties, enquêtes, interviews en logboeken van gebruikersinteracties om inzichten in co-creatie af te leiden. Dit project bevordert de toepassing van Citizen Science onder lokale gemeenschappen en stimuleert Open Science praktijken binnen het AI for Social Good veld door AI-onderzoek te koppelen aan maatschappelijke problemen.

Bekijk het onderzoek van dr. Y. Hsu op ORCID

Building a Community of Practice for Open Naturally Occurring Data (CoP 4 ONOD)
Dr. B.R. Huma - VU Amsterdam

Teamleden:

Toegankelijke, deelbare en herbruikbare data zijn essentieel voor Open Science. Kwalitatieve onderzoekers uit verschillende vakgebieden maken vaak gebruik van natuurlijk voorkomende data (audio-, video- en digitale opnames van real-life gesprekken), die zeer geschikt zijn voor hergebruik, maar het delen ervan gaat gepaard met serieuze uitdagingen t.a.v. privacy en vertrouwelijkheid, vanwege ingewikkelde en voortdurend veranderende privacyregelgeving. Er bestaan nog geen duurzame richtlijnen voor het “openstellen” van dergelijke data. Dit project zal een “Community of Practice” creëren, ondersteund door een online platform, om goede praktijken aangaande Open Science in kwalitatief onderzoek met natuurlijk voorkomende data te verzamelen, verbeteren, overdenken en promoten.

Bekijk het onderzoek van dr. B.R. Huma op ORCID

J

StormAE: The Probabilistic Model Checker Storm for Almost Everyone
Dr. J.S.L Junges - Radboud University

Teamleden:

  • J.-P. Katoen (RWTH Aachen University, Germany)
  • T. Quatmann (RWTH Aachen University, Germany)
  • M. Volk (Technical University Eindhoven / University of Twente)

Probabilistisch model checken is een populaire techniek om bepaalde, wiskundige modellen te analyseren. Deze modellen worden vaak gebruikt om system te beschrijven waarin onzekerheden over hun gedrag een belangrijke rol speelt. De model checker Storm is een snelle en breed toegepaste software die oorspronkelijk is ontworpen voor experts op het gebied van model checking. De software is daarom minder geschikt voor een breder publiek. Het StormAE project verbetert de interfaces en documentatie zodat meer onderzoekers kunnen voortborduren op de methodes in Storm om zo beter en efficiënter onderzoek te kunnen doen.

Bekijk het onderzoek van dr. J.S.L. Junges op ORCID

K

GreenLight2.0: inclusive, accessible, and open horticultural greenhouse modelling
Dr. D. Katzin - Wageningen University & Research

Teamleden:

  • K. Kahlen (Hochschule Geisenheim University, Germany)
  • F. Domingo Molina Aiz (University of Almería, Spain)
  • A. Stuks (Synergy Solutions, Latvia),
  • M-P. Trépanier (Université Laval, Canada)

Simulatiemodellen worden veel gebruikt in het glastuinbouwonderzoek, bijvoorbeeld om manieren te vinden om het energieverbruik van kassen te verminderen en tegelijkertijd de productie van voedzame groenten te behouden. Dit project zal een nieuw kasmodel ontwikkelen dat open is, toepasbaar voor wereldwijde scenario's, en aantrekkelijk voor alle kasonderzoekers. Het model zal een gemeenschappelijk en modulair raamwerk bieden voor onderzoekers, waardoor onderzoek kan worden gedeeld, uitgebreid en vergeleken. Het diverse team van het project zal het model promoten, waardoor een brede onderzoeksgemeenschap wordt geïnitieerd die aan een gedeeld, gemeenschappelijk raamwerk werkt, voor de eerste keer op het gebied van kasmodellering.

Bekijk het onderzoek van dr. D. Katzin op ORCID

Open Matrices: A global, free resource for testing cognitive ability
Prof. dr. R.A. Kievit - Radboud UMC

Teamleden:

Abstract redeneren is het vermogen om nieuwe, abstracte problemen op te lossen die niet van concrete kennis afhankelijk zijn. Individuele verschillen in deze vaardigheid voorspellen belangrijke uitkomsten zoals schoolsucces, levensduur, carrièreontwikkeling en fysieke en mentale gezondheid1-3. Standaardtests zoals Raven’s matrices en de Cattell Culture Fair zijn echter duur, waardoor landen en laboratoria met minder middelen ze niet kunnen gebruiken, en beperkt in aantal items, waardoor ze niet kunnen worden gebruikt in longitudinale of ‘experience sampling’ studies. Het Open Matrices-project zal (1) een set abstracte redeneringsitems ontwikkelen, (2) valideren en (3) beschikbaar maken voor de gehele (wetenschappelijke) gemeenschap.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. R.A. Kievit op ORCID

M

WooFAIR: Making Open Government Data FAIR.
Dr. M.J. Marx - University of Amsterdam

Teamleden:

De enorme hoeveelheid documenten vrijgegeven onder de Wet Open Overheid (Woo) door meer dan 2.500 bestuursorganen vormt een waardevolle bron van wetenschappelijke informatie, die gebruikt kan worden om AImodellen te trainen, voor historische analyses, of voor bestuurskundig onderzoek. Zulk wetenschappelijk hergebruik op grote schaal is alleen mogelijk als deze stukken beschikbaar zijn als FAIR wetenschappelijke data. Door de wijze van publiceren is dit nu niet het geval. Dit project stimuleert een cultuuromslag bij de bestuursorganen om hun Woo-stukken vrij te geven volgens de FAIR data principes. Dit doen we met drie instrumenten: bewustmaking, het geven van technische hulp, en "nudging".

Bekijk het onderzoek van dr. M.J. Marx op ORCID

O

CODECHECKing goes NL - strengthening open science through reproducible publications in the Netherlands (CHECK-NL)
Dr. F.O. Ostermann - University of Twente

Teamleden:

Veel onderzoeksresultaten zijn afhankelijk van computationele methoden. Open-Science principes vereisen dat deze worden gedeeld en reproduceerbaar zijn. In traditionele wetenschappelijke publicaties worden computationele methoden echter zelden opnieuw uitgevoerd tijdens de beoordeling. In dit voorstel streven we ernaar om de computationele workflows van tenminste 50 wetenschappelijke artikelen te controleren op reproduceerbaarheid, en we streven naar een overeenkomst met tijdschriftredacties om een dergelijke controle routinematig in te voeren in hun beoordelingsproces. Als kickstart organiseren we roadshows op vier locaties om ervaren en nieuwe code beoordelaars, auteurs en editors samen te brengen om gezamenlijk een “codechecking” van wetenschappelijke analyses duurzaam te implementeren.

Bekijk het onderzoek van dr. F.O. Ostermann op ORCID

P

Enabling Open Science in Qualitative Research: The Reproducible Open Coding Kit (ROCK)
Dr. G.J. Peters - Open University

Teamleden:

Het is niet vanzelfsprekend hoe kwalitatief onderzoek (bijvoorbeeld waarbij mensen worden geïnterviewd en de audio-opnames worden getranscribeerd en gecodeerd) volgens open science principes kan worden uitgevoerd. In dit project wordt een standaard die hiervoor is ontworpen uitgewerkt en worden een aantal hulpmiddelen ontwikkeld om met deze standaard te werken en om dat te leren. Specifiek wordt de "Reproducible Open Coding Kit" uitgewerkt en worden er twee softwarepakketten ontwikkeld om hiermee te werken: een R package en een grafische interface. Tot slot worden er openbaar beschikbare onderwijsmiddelen ontwikkeld die helpen om te leren hiermee te werken.

Bekijk het onderzoek van dr. G.J. Peters op ORCID

R

Promoting Open Science Teaching: A Positive, Inclusive and Participatory Program for Educators (POST-Edu)
Dr. L.R.M. Rettore Micheli - Leiden University

Teamleden:

Om wetenschappelijke standaarden te kunnen waarborgen en verhogen, moet de volgende generatie onderzoekers en wetenschapsconsumenten toegerust zijn met kennis over open en reproduceerbare onderzoek. Dit betekent dat onderwijzers en mentoren een stevige basis moeten kunnen bieden in hun onderwijs over open wetenschap. Wij beogen een pedagogisch geïnformeerd, op bewijs gebaseerd zelf-begeleid programma te ontwikkelen ter ondersteuning van onderwijzers die geïnteresseerd zijn in open wetenschap. In synergie met onderwijzers, ontwikkelen en evalueren we drie modules waarin we open wetenschap beschouwen door een 1) positieve, 2) participatieve, en 3) inclusieve lens. De ontwikkelde materialen zullen worden verspreid als een open toegankelijke cursus.

Bekijk het onderzoek van dr. L.R.M. Rettore Micheli op ORCID

Mini Many Labs: Creating a shared infrastructure for collaborating within the Experience Sampling Method community to improve reproducibility
Dr. G.H. van Roekel -Tilburg University

Teamleden:

Onderzoekers maken steeds meer gebruik van smartphone dagboektechnieken, zoals de experience sampling methode (ESM), om de dagelijkse dynamische processen te begrijpen die ten grondslag liggen aan psychologische fenomenen. ESM is in opkomst, maar blijft een methodologisch ‘wild west’, waarin methodologische uitdagingen een bedreiging vormen voor transparantie, reproduceerbaarheid en repliceerbaarheid. Het Mini Many Labs-project zal een open platform en infrastructuur creëren om samenwerking te bevorderen en open- en team-science te stimuleren binnen de ESM-onderzoeksgemeenschap, door het faciliteren van gezamenlijke onderzoeksprojecten en het inbedden van open-science practices, om zo een cultuurverandering teweeg te brengen in een veld waar open-science niet is genormaliseerd.

Bekijk het onderzoek van dr. G.H. van Roekel op ORCID

S

Open Standards for Goal-Driven Sensorimotor Modelling: Unifying a Rising Paradigm under a Community-Driven Ecosystem
Dr. M. Senden - Maastricht University

Teamleden:

Recente computationele innovaties hebben modellen van het brein verbeterd, zowel in taken die ze kunnen uitvoeren, zoals objectherkenning, als in biologische gelijkenis. Hoewel dit onderzoeksparadigma voorheen beperkt was tot neurowetenschappelijk onderzoek naar zicht, heeft ons groep nu software ontwikkeld waarmee we ook kunnen modelleren hoe het brein ons lichaam aanstuurt om te kunnen bewegen in de wereld. Om ervoor te zorgen dat toekomstig werk met deze sofwaretool coöperatief-gedreven is en kennis in dit onderzoeksparadigma makkelijk gedeeld kan worden in de onderzoeksgemeenschap, zullen we open standaarden en een begeleidend ecosysteem ontwikkelen die interoperabiliteit waarborgen volgens de principes van Open Science.

Bekijk het onderzoek van dr. M. Senden op ORCID

Oral History-Collaborative Open Science Research Environment (OH-CORE)
Dr. S. Stigter - University of Amsterdam

Teamleden:

  • L. Wolfkamp (University of Amsterdam )
  • I. Janmaat (SURF)
  • J. Touber (DANS-KNAW)

Het project wil de barrières verlagen die onderzoekers tegenkomen bij het analyseren, deponeren en hergebruiken van interview data, en samenwerking mogelijk maken tussen onderzoekers en instellingen bij het werken met privacygevoelige data. Het doel is om het duurzaam bewaren en veilig ontsluiten van uniek bronmateriaal voor de sociale- en geesteswetenschappen aanzienlijk te verbeteren. Met interviewmateriaal van de Universiteit van Amsterdam en bestaande infrastructurele componenten, ontwikkelen SURF en DANS-KNAW een dynamische virtuele oral history onderzoeksomgeving, waarin door de data-eigenaar geautoriseerde onderzoekers kunnen samenwerken. Het nieuwe systeem zal generiek inzetbaar zijn en eenvoudig in te bedden in de nationale digitale onderzoeksinfrastructuur.

Bekijk het onderzoek van dr. S. Stigter op ORCID

In the eye of the public: Citizen science to overcome sampling biases in visual attention research
Dr. C. Strauch - Utrecht University

Teamleden:

Hoe vinden we een sleutel die zoek is? Eye-tracking is de beste manier om visueel zoekgedrag te onderzoeken, maar het verzamelen van deze data is duur waardoor steekproeven klein en niet-representatief zijn; vooral studenten worden onderzocht. Door een Open Science Citizen approach zorgen wij voor grotere en representatievere steekproeven. We verbeteren een bestaande eye-tracking setup in het NEMO museum om de grootste openlijk beschikbare dataset naar visueel zoeken ter wereld te creëren. Zo kunnen we bevindingen terugkoppelen naar het brede publiek. FAIR-dataverwerking en -analyses helpen anderen om soortgelijke installaties te implementeren, representativiteit te waarborgen en visueel aandachtsonderzoek te faciliteren.

Bekijk het onderzoek van dr. C. Strauch op ORCID

T

Accelerating Social Research Tools Through Open-Source and AI: Extending the CPF Data Harmonization Model (CROWDSS_CPF)
Dr. K.L. Turek - Tilburg University

Teamleden:

  • M. Kalmijn (Netherlands Interdisciplinary Demographic Institute (NIDI-KNAW)

Dit project zal het eerste open-source dataharmonisatie-initiatief in de sociale wetenschappen, het Comparative Panel File (CPF), opschalen en uitbreiden. CPF integreert zeven grote huishoudpanelonderzoeken en biedt uitgebreide mogelijkheden voor vergelijkend levenslooponderzoek. Door het innovatieve, crowd-based ontwerp zijn er de afgelopen drie jaar verschillende initiatieven ontstaan rondom het CPF. Dit project zal deze integreren, het platform verder ontwikkelen en nieuwe tools toevoegen om open samenwerking en beheer te verbeteren (gebaseerd op artificial intelligence en software engineering). We streven ernaar een duurzaam open samenwerkingsmodel op te bouwen en het te promoten als een krachtige aanvulling op conventionele infrastructuur in de sociale wetenschappen.

Bekijk het onderzoek van dr. K.L. Turek op ORCID

V

Automated Machine Learning for all
Dr. ir. J. Vanschoren - Eindhoven University of Technology

Teamleden:

Machine Learning (ML) is steeds crucialer in wetenschappelijk onderzoek, maar vereist aanzienlijke expertise om het correct en effectief te gebruiken. ‘Automated machine learning’ (AutoML) democratiseert ML door automatisch machine learning modellen te ontwerpen en te optimaliseren, om onderzoekers te inspireren en betere resultaten te behalen. OpenML is een platform voor het delen van open ML datasets, alsook de beste ML modellen. Dit project brengt ze samen op een unieke manier. Het zal het uploaden van open datasets vergemakkelijken, gebruikmaken van AutoML om automatisch ML modellen te bouwen, en intuïtieve rapporten genereren om wetenschappers te helpen in vele verschillende vakgebieden.

Bekijk het onderzoek van dr. ir. J. Vanschoren op ORCID

ModelPlaza:  an open platform for computer simulations of past socio-ecological systems
Dr. J.W.H.P. Verhagen - VU Amsterdam

Teamleden:

Archeologen maken steeds meer gebruik van computersimulaties om samenlevingen uit het verleden te reconstrueren en te begrijpen. Zij bouwen en gebruiken met succes simulaties van landbouwproductie, handel, ontwikkeling van nederzettingen en vervoer, om er enkele te noemen. Met de toenemende verbreiding van modelbenaderingen is het noodzakelijk dat deze simulaties toegankelijk worden gemaakt en gebruikt kunnen worden als input voor toekomstig onderzoek. Dit project zal een platform opzetten voor het onderbrengen van een bibliotheek van modellen en algoritmen voor het simuleren van het verleden, alsmede opleidingsmateriaal om een bredere betrokkenheid van onderzoekers mogelijk te maken, nu en in de toekomst.

Bekijk het onderzoek van dr. J.W.H.P. Verhagen op ORCID

W

OPENBRAIN: Using All-Resolutions Inference to make brain activation studies more open
Dr. W.D. Weeda - Leiden University

Teamleden:

Gegevens uit hersenonderzoek worden sinds oudsher geanalyseerd met dezelfde statistische technieken. Deze technieken zijn verouderd en lenen zich niet goed om resultaten binnen en tussen studies te vergelijken. Hierdoor is het lastig voor onderzoekers om Open Science richtlijnen te gebruiken. Wij hebben een nieuwe statistische methode ontwikkeld die deze problemen oplost. Hierdoor zijn resultaten beter te interpreteren en reproduceren. In dit project willen we vrij toegankelijke (open-source) software en verbeterde richtlijnen ontwikkelen voor het analyseren van data met behulp van deze nieuwe methode. Op deze manier hopen we het gebruik van Open Science in het veld te stimuleren.

Bekijk het onderzoek van dr. W.D. Weeda op ORCID

Open Toolset for Earth Observation-based Nature Conservation and Restoration Impact Evaluation - OpenCoRe
Prof. dr. L.L.J.M. Willemen - University of Twente

Teamleden:

Het herstel van aangetaste ecosystemen en de bescherming van intacte ecosystemen zijn cruciale acties om de gevolgen van klimaatverandering en het verlies aan biodiversiteit tegen te gaan. Aardobservatie door satellieten kan helpen om de impact van herstel- en instandhoudingsinterventies te evalueren en om beperkte middelen efficiënter te besteden. Helaas ontbreekt het vaak aan praktische kennis van aardobservatiedata en -toepassingen bij betrokkenen in natuurbehoud en -herstel, en ontbreken momenteel gebruikersgerichte toepassingen die de verwerking van aardobservatiegegevens en impact-evaluatie integreren. Wij stellen hier de ontwikkeling van dergelijke, ‘open’ software voor.

Bekijk het onderzoek van prof. dr. L.L.J.M. Willemen op ORCID

The Chemistry Development Kit in 2024: improving cheminformatics research (CDK2024)
Dr. E.L. Willighagen - Maastricht University

Teamleden:

Chemoinformatica is een onderzoeksveld dat zich bezighoudt met informatie over chemische systemen. Dat zijn onder meer de chemische structuur die gebruikt wordt voor berekeningen waar quantumchemie te lang duurt. De “Chemistry Development Kit” (CDK) was een van de eerste wetenschappelijke Open Science software voor de chemie, mede opgericht in Nederland. De oudste broncode komt nog uit 1997 en de CDK wordt al meer dan 25 jaar actief onderhouden. De CDK ondersteunt onderzoek in medicijnontwikkeling, toxicologie, en bioinformatica. Dit project ondersteunt het onderhoud en helpt gebruikers de meest recente versie te gebruiken.

Bekijk het onderzoek van dr. E.L. Willighagen op ORCID

Z

Copula-based virtual patient simulation as tool to enable community access to patient population characteristics without sharing patient-data
Dr. L.B. Zwep - Leiden University

Teamleden:

Toegang tot individuele klinische patiëntengegevens is essentieel voor de ontwikkeling van nieuwe behandelstrategieën en voor biomedisch onderzoek in het algemeen. Hoewel dergelijke data routinematig verzameld worden in dat kliniek is het delen ervan strikt reguleert. Wij stellen het gebruik van copula modellen voor om het delen van patiëntengegevens te faciliteren. Nadat een copula op een patiëntendatabase is ontwikkeld, kan het model gedeeld worden en gebruikt om datasets met individuele eigenschappen van patiënten te simuleren zonder dat de oorspronkelijke beschermde patiëntgegevens gedeeld hoeven te worden. In dit project ontwikkelen wij software en trainingsmaterialen om het gebruik van copulas te faciliteren.

Bekijk het onderzoek van dr. L.B. Zwep op ORCID