La plus connue des réunions interministérielles est la tenue du Conseil des ministres au palais de l’Élysée, sous la présidence du président de la République. Il s'agit de la seule formation gouvernementale prévue par la Constitution (article 9).
Toutes les décisions importantes prises par le Gouvernement, notamment les projets de lois, les ordonnances et les décrets, y sont délibérées, ou au moins annoncées. Ces décisions deviennent celles de tous les membres du Gouvernement, qui doivent dès lors les défendre.
Le Conseil des ministres est organisé une fois par semaine, traditionnellement le mercredi. Il réunit tous les ministres. En général, les secrétaires d’État y participent quand leur compétence est à l'ordre du jour.
D'autres réunions ont pour objectif de parvenir à une coordination optimale :
- les réunions interministérielles (RIM), regroupant, sous la présidence d’un membre du cabinet du Premier ministre ou de son directeur de cabinet, des membres des cabinets ministériels concernés par un sujet précis ;
- les comités restreints, réunissant, occasionnellement et sur convocation du Premier ministre, des ministres et des hauts fonctionnaires concernés par une question spécifique ;
- les comités interministériels : créés par décret et consacrés à un domaine particulier, ils réunissent à intervalle régulier, sous la présidence du Premier ministre, les ministres concernés et un collaborateur du chef de l’État (ex : le Comité interministériel de la sécurité routière créé en 1972, le Comité interministériel de la transformation publique créé en février 2018).
Le Premier ministre dispose de services visant à assurer la coordination de l'activité des différents ministères :
- le Secrétariat général du Gouvernement (SGG) ;
- le Secrétariat général des affaires européennes (SGAE), chargé de l'unification des positions des différents ministères sur les questions européennes et les activités de l'Organisation de coopération et de développement économiques (OCDE). Cette institution a pris une importance décisive, au fur et à mesure de l’accroissement de l’engagement européen de la France ;
- le Secrétariat d'information du Gouvernement (SIG), qui pilote et coordonne au niveau interministériel la communication gouvernementale.