PCR, sérologique, antigénique, salivaire : quel test de dépistage de la Covid-19 faire ?

tests Covid-19
Tester le plus grand nombre serait la clé pour faire reculer la progression du coronavirus. Quels sont les différents types de tests ? Qui peut bénéficier d'un dépistage et sous quelles conditions ? Où peut-on se faire dépister ? Toutes les réponses aux questions que l'on se pose sur le dépistage de la Covid-19.

Difficile de s'y retrouver dans la multitude de tests mis à notre disposition dans le cadre du dépistage de la Covid-19 et de ses variants

Tests virologiques, sérologiques, salivaires : quelles différences ? Sont-ils gratuits ? Qui peut se faire tester ? Où se faire dépister ? Toutes les réponses aux questions que l'on se pose sur les tests Covid-19. 

Les tests virologiques (RT-PCR)

Ce prélèvement nasopharyngé (gorge, nez, nasopharynx) permet de déterminer si une personne est porteuse du coronavirus au moment du test. Outre les biologistes médicaux et techniciens de laboratoire, les infirmiers diplômés d’Etat, les étudiants en odontologie, en maïeutique et en pharmacie, les aides-soignants, les sapeurs-pompiers, les marins-pompiers et les secouristes des associations agréées de sécurité civile, peuvent réaliser ces tests. 

Les indications : ce sont les tests de référence pour le diagnostic précoce d’infection à la Covid-19. Tout le monde, même les personnes ne présentant pas de symptômes, peut demander à passer ces tests. 

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"Si vous avez été identifié comme cas contact, vous serez contacté par les services de l’Assurance Maladie qui vous demanderont de rester en 'quatorzaine préventive' et vous indiqueront quand réaliser votre test (immédiatement si vous vivez dans le même foyer que la personne contaminée, ou en observant un délai de 7 jours après votre dernier contact avec cette personne, si vous ne vivez pas avec elle), précise le ministère de la Santé. Vous devrez alors prendre rendez-vous dans un lieu d’examen médical. Aucune prescription médicale ne vous sera demandé."

Comment se déroule le test ? Un écouvillon (sorte de long bâton fin ressemblant à un coton-tige) est introduit dans chaque narine et dirigé en direction de l’oreille pendant plusieurs secondes. L'acte ne fait pas mal, mais est assez désagréable on ne va pas se mentir. Au moment du prélèvement, vos yeux peuvent se mettre à pleurer. Pas de panique : c'est une réaction tout à fait normale et naturelle. Les résultats sont généralement disponibles sous quelques jours. 

Où se faire dépister ? Les sites Santé.fr et Drivecovid.fr répertorient tous les points de prélèvement des tests RT-PCR proches de votre lieu de résidence.

Les tests sérologiques 

Ces tests détectent la présence d'anticorps, notamment IgM et IgG. Ceux-ci confirment si une personne a développé la maladie, même sans avoir pour autant présenté des symptômes, comme c'est le cas pour les patients dits asymptomatiques.

En complément de la RT-PCR, les tests sérologiques "peuvent permettre de répondre à la question 'suis-je ou ai-je été malade de la Covid ?'", explique la HAS. Cependant, ces derniers ne permettent pas de répondre aux questions "Suis-je contagieux ?" et "Suis-je protégé contre la Covid-19 ?".

"La production d’IgM et/ou d’IgG n’étant détectable chez les patients symptomatiques qu’à partir de la deuxième semaine suivant l’apparition des symptômes, les tests sérologiques ne sont donc pas recommandés dans le cadre du diagnostic précoce de l’infection COVID-19 lors de la première semaine suivant l’apparition des symptômes", précise la Haute Autorité de Santé.

Il faut distinguer quatre types de tests sérologiques : les tests automatisables (de type ELISA) ; les tests de diagnostic rapide (TDR) ; les tests rapides d'orientation diagnostique (TROD) ; les autotests (ceux-ci sont interdits en France car peu fiables). 

Il existe une liste officielle des tests homologués et validés par le ministère des Solidarités et la Santé (consultable sur ce site).

Les indications (définies par la HAS) :

  • En diagnostic initial pour les patients symptomatiques graves hospitalisés, dont la RT-PCR est négative mais chez qui les symptômes cliniques ou le scanner sont évocateurs d’un COVID-19. 

  • En diagnostic de rattrapage de patients symptomatiques graves hospitalisés mais qui n’ont pas eu un test RT-PCR dans les sept premiers jours. 

  • En diagnostic initial de patients symptomatiques sans signes de gravité suivis en ambulatoire dont le test RT-PCR est négatif mais dont le tableau clinique est évocateur. 

  • En diagnostic de rattrapage de patients symptomatiques sans signes de gravité suivis en ambulatoire mais chez qui un test RT-PCR n’a pu être réalisé avant 7 jours. 

  • En diagnostic différé des patients symptomatiques sans signes de gravité diagnostiqués cliniquement mais n’ayant pas fait l’objet d’une RT-PCR et ce depuis la mise en place de la phase 2 (à partir du 2 mars 2020). 

  • En détection d’anticorps chez les professionnels soignants asymptomatiques, en complément du dépistage et de la détection de personne-contact par RT-PCR selon les recommandations en vigueur, si la RT-PCR est négative. 

  • En détection d’anticorps chez les personnels d’hébergement collectif (établissements sociaux et médico sociaux, prisons, casernes, résidences universitaires, internats, …) asymptomatiques en complément du dépistage et de la détection de personne-contact par RT-PCR selon les recommandations en vigueur, si la RT-PCR est négative.  

Comment se déroule le test ? Il s'agit d'une prise de sang (tests automatisables ; TDR) ou du prélèvement d'une simple gouttelette de sang (TROD).

Où se faire dépister ? dans un laboratoire de biologie médicale (ELISA ; TDR), chez un médecin traitant ou en pharmacie (TROD). 

Les tests antigéniques (TRA)

Tout comme les tests PCR, les tests antigéniques permettent de savoir si l'on est infecté à l'instant T et consistent à réaliser un prélèvement dans le nez à l'aide d'un écouvillon. Le prélèvement est ensuite "mélangé à un réactif, directement sur une bandelette, qui se colore en présence du virus, à la manière d’un test de grossesse", détaille Le Monde. Contrairement aux RT-PCR, les tests antigéniques ne recherchent pas la présence d'ARN (code génétique du virus), mais détectent les antigènes du SARS-CoV-2, des protéines produites par le virus. 

Moins cher, plus simple à réaliser et plus rapide (30 minutes suffisent pour obtenir un résultat), le test antigénique est remboursé à 100% par l’Assurance maladie. En cas de résultat positif, le test antigénique doit être confirmé par la réalisation d'un test RT-PCR. 

À savoir : les tests antigéniques peuvent être pratiqués par les médecins, infirmier.e.s diplômé.e.s d’État, les masseurs-kinésithérapeuthes, les sages-femmes, les dentistes et les pharmacien.ne.s.

Les tests salivaires ? 

Les tests salivaires ne sont, pour l'heure, pas disponibles en raison de la difficulté à démontrer leur réel fiabilité. La perte de sensibilité du test reste notamment à évaluer afin d'éviter des faux négatifs. 

Dans un avis publié le 7 août par la Haute Autorité de Santé, celle-ci estime que "cet acte pourrait constituer une alternative aux prélèvements nasopharyngés (RT-PCR). Contrairement à ce dernier, "dont le caractère invasif limite l’acceptabilité par les patients, surtout en cas de test répété, explique-t-elle, le prélèvement salivaire, plus facile à réaliser et parfaitement indolore, pourrait permettre d’augmenter l’acceptabilité du test, voire sa faisabilité. Et d'ajouter : "Le recours aux tests salivaires pourrait également permettre d’accroître les capacités de test dans des situations de dépistage où le prélèvement nasopharyngé est difficile à réaliser."

Depuis lundi 15 février 2021, la start-up marseillaise C4Diagnostics réalise des essais cliniques de tests de diagnostic salivaire. 

Comment se déroule ce test ? "Il suffit de cracher dans un tube, la salive est ensuite traitée (...) Le tube est placé dans un boîtier nommé lecteur C4Reader-T8. Si rien ne se passe, le test est négatif. Si une fluorescence est détectée, le test est positif", a détaillé France 3 Provence-Alpes-Côté d'Azur lors d'un reportage au centre de dépistage du parc Chanot à Marseille. Il faut en moyenne entre 20 et 30 minutes pour obtenir un résultat. 

"Ce test moléculaire utilise la technologie RT-LAMP, basée sur l'amplification de morceaux d'ADN du virus, Contrairement à la technique PCR, elle ne nécessite pas d'être en laboratoire. Le lecteur de détection est petit et mobile." 

Si l'étude est concluante, le kit pourrait être commercialisé d'ici mars 2021. "Une fois mis sur le marché, le test serait au prix de 30 euros, contre 43,20 euros pour la PCR. La société C4Diagnostics va demander le remboursement intégral par la Sécurité sociale", précise France 3.

Et les tests de dépistage des variants  ?

Le Pr Jérôme Salomon, Directeur général de la Santé, précise dans un document adressé aux professionnels de santé que "tout test, antigénique ou PCR, donnant lieu à un résultat positif doit désormais obligatoirement faire l’objet d’une RT-PCR de criblage en seconde intention, réalisée dans un délai de 36h maximum, afin de déterminer s’il s’agit d’une contamination par une variante d’intérêt."

Les laboratoires "réalisant les tests de criblage doivent en transmettre les résultats aux laboratoires ayant réalisé le test de première intention, qui ont la responsabilité de signaler à la personne contaminée qu’il s’agit d’une contamination par une variante d’intérêt, et laquelle, détaille-t-il. Par ailleurs, cette information sera ensuite confirmée par le traceur de l’Assurance maladie en charge du contact-tracing."

Les tests de dépistage de la Covid-19 sont-ils gratuits ?

Un arrêté publié le 25 juillet 2020 au Journal officiel permet à toute personne de se présenter dans un laboratoire d’analyse sans prescription médicale préalable afin de réaliser un test de dépistage virologique (RT-PCR) de la Covid-19. Ce test, dont le coût est de 54 euros, est remboursé à 100% par l'Assurance maladie. Ces dispositions sont également valables pour les personnes qui ne sont pas assurés sociaux.

Le test sérologique est entièrement pris en charge par l’Assurance maladie, uniquement s'il est accompagné d'une ordonnance médicale et figure sur la liste des tests homologués. "Les prix de référence fixés pour le remboursement de l’acte de réalisation d’un test sérologique sont respectivement de 12,15 euros pour un test ELISA et de 9,45 euros pour un test de diagnostic rapide", détaille le ministère de la Santé. 

À savoir : les résultats des tests de dépistage de la Covid-19 effectués en laboratoire sont systématiquement enregistrés sur la plateforme sécurisée SI-DEP (Système d’Informations de DEPistage). "Le patient qui effectue un test Covid-19 ne peut pas s’opposer au traitement de ses données dans l’outil SI-DEP, du fait de l’intérêt public que ce suivi représente", prévient le ministère de la Santé. 

Que faire si mon test est positif ? 

Si le résultat du test se révèle positif et après consultation d'un médecin, l'Assurance maladie conseille aux patients de s'isoler jusqu’à la guérison : au minimum 8 jours après l’apparition des premiers signes de la maladie (ou 10 jours pour les personnes à risque élevé de faire une forme grave de la maladie ou celles porteuses des variants sud-africain et brésilien) et 2 jours après la disparition de la fièvre ou des difficultés respiratoires.

Aussi, une prescription de masques chirurgicaux (2 par jour pendant toute la durée de l’isolement) sera fournie pour la durée de l’isolement, à retirer ou à faire retirer par ses proches en pharmacie. Si nécessaire, un arrêt de travail sera donné ou envoyé au patient pour couvrir la période d’isolement.

Durant cette période de confinement, il est conseillé de prendre sa température 2 fois par jour. En cas de fièvre ou de maux de tête, prendre du paracétamol (et non de l’ibuprofène), pas plus de 1 gramme et jusqu’à 3 fois par jour (soit 3 grammes au total). Les traitements habituels doivent être poursuivis. Il faut également veiller à continuer de respecter scrupuleusement les gestes barrières

Enfin, si les symptômes venaient à s'aggraver, contacter un médecin au plus vite. En cas de difficultés à respirer, appeler immédiatement le 15 (ou le 114 pour les personnes sourdes ou malentendantes).

Note importante : les recommandations émises par les autorités de santé peuvent évoluer en fonction de la situation sanitaire. 

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